SAL dispone di un Laboratorio Analisi (costituito da un laboratorio batteriologico ed un laboratorio chimico) che controlla direttamente il rispetto dei requisiti imposti dalla normativa vigente sulla qualità delle acque destinate al consumo umano (D.lgs 31/01) e sugli scarichi degli impianti di trattamento delle acque reflue (D.lgs. 152/06).
Il Laboratorio Analisi svolge, inoltre attività di campionamento e analisi di acque potabili, superficiali, reflue e di processo anche per conto terzi.